各種作物栽培法對各種不同之作物及地區適應性都有不同,水耕栽培也不例外,仍有其優點及缺點,取其優而補其缺是研究的方向及要領,以下提出水耕栽培的優點及常見的缺點,以供參考:
(1)水耕栽培的作物生長迅速:這是水耕栽培最大的優點,但需要提供良好的生長環境,例如要有適當的溫度及日照,夏季溫室的高溫都將影響許多作物的生長。
因為水耕栽培的營養分是連續供應植物的根部,也就是說營養成分與根的接觸是直接的,沒有阻礙,使作物充分吸收營養,生長就迅速多了。如果四季均能生長良好的作物,或選擇適合的作物配合環境,就可以提高單位面積的生產力。
(2)水耕栽培減少植物病原菌的來源:這也是水耕栽培的優點,但這並不表示水耕栽培的植物不會發生病蟲害,也不表示水耕栽培保證不必噴農藥。水耕栽培的基質及材料可以減少植物病菌的危害。但是植物的病蟲害發生及來源,不是只限於來自培養的材料,病蟲害傳播可以來自空氣,種苗及栽培的環境四周。因此水耕栽培為了減少其他來源的病蟲害,需要配合溫室、網室或其他設施及設備。一般水耕栽培初次種植時病蟲害較少,但經多次種植後需要加強環境的管理;否則,病蟲害也會和自然田間一樣的嚴重或更嚴重。一般而言,生長迅速的水耕作物,抗病抗蟲性都較有問題,甚至一發不可收拾的局面,那時是否也要噴藥了呢?
(3)水耕栽培需重視技術及投資成本:水耕栽培並不難,但要事先充分瞭解生產的技術及要領。要生產有經濟效益的作物時,尤其需要重視營養基質及季節,配合作物的品種需求,更需要研究及開發降低投資成本,講求省事及自動化設施,可減少甚多勞力。尤其在大面積生產,問題甚多,需要充分的瞭解及準備;否則,容易遭受失敗的結果。如果管理不當,在培養液的濃度及 PH變化劇烈下,作物的根部很快就受到傷害,因此管理及營養液之配方需要特別注意。
(4)水耕栽培需要注意營養液中藻類及微生物的滋長:營養液的栽培系統甚難防止微生物及藻類繁殖,而這些微生物中將吸收部分之營養及氧氣,雖然藻類白天進行光合作用放出氧氣,但夜間則正相反。甚至某些微生物也將分泌大量有毒物質,也可能影響作物生長。如果有病原菌侵入,則其蔓延甚快。
(5)水耕栽培需加強檢查營養配方的健全性及產品的安全性:水耕的營養液配方一般主要使作物長得好長得快,但水耕配方中可能缺乏人體所需的物質,尤其在現在的科學知識有限之下,水耕栽培的產品無法像土壤中栽培的健全是可以推測的。生命科學在 30多年來已大有進步,可是對人類的抗病、抗癌及健康與天然物質有關的知識尚嫌不足,只在有限的營養配方中生長的作物,將產生何種缺失,不是立即能估計的,這點值得討論與思考。
舉一例來說明,現在科學知識中已知硒(Se)是人類的微量元素,尤其最近更顯示癌症、心臟疾病及其他疾病與體內的硒含量有關。過去並不知硒有何重要,因為在土壤栽培的食物一般都含有這個元素。因為硒就像其地重金屬一樣,大量攝取是有毒的,如果人們不知硒是重要的微量元素,誰敢加入培養液中呢?長期食用不健全的食物或偏食不健全的食物,都可能是問題的來源。
水耕栽培作物可以大量直接吸收加入營養,這些營養是植物營養,不一定是人體的營養,我們需要有這種認知。尤其吸收大量無機營養的作物,若未經轉化而累積,它的安全性需要列入考慮,尤其需要控制硝態氮或亞硝態氮,以及所用植物養分中所含之重金屬的問題,需要觀察及檢測,並加強產品品質。
(6)水耕栽培的基質或營養液需重視循環利用,減少對環境污染:水耕栽培的營養液或基質使用數次後,由於作物根部分泌物的大量釋放,不易種出優良的產品,於是需要棄置。不當的棄置也可能造成環境污染,尤其是大量使用過的營養液被棄置,應重視棄置的位置,及循環再利用的研究。